SARS病毒和其他冠状病毒中性突变速率初步的比较研究

被引：4

作者：

孙慧敏 ^{[1
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唐晓凤 ^{[2
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王波 ^{[1
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谭雅慧 ^{[1
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于晓寒 ^{[1
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张景霞 ^{[1
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闫永平 ^{[1
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夏结来 ^{[3
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徐德忠 ^{[1
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机构：

[1] 第四军医大学预防系流行病学教研室

[2] 第四军医大学门诊部

[3] 第四军医大学预防系卫生统计学教研室

来源：

中华疾病控制杂志 | 2011年 / 12期

关键词：

SARS病毒; 冠状病毒科; 中性突变速率;

D O I：

暂无

中图分类号：

R373 [人体病毒学（致病病毒）];

学科分类号：

100103 ; 100705 ;

摘要：

目的比较SARS冠状病毒(SARS-CoV)与第1至第3组(其他3组)冠状病毒的中性突变速率之异同,为更深入研究SARS-CoV起源提供新的思路。方法在美国国立生物技术信息中心中获取其他3组26条病毒序列,同时选取7条SARS-CoV序列。计算各病毒株5个主要基因串联序列的同义替换核苷酸的数量(Ks值),以此值与时间创建散点图,并进行直线拟合,取得各自中性突变速率并比较。结果 SARS-CoV中性突变速率为7.33×10-6/位点.天,而其他3组冠状病毒为2×10-6/位点.天,仅约前者的1/3.5,但决定系数R2极低,无意义。经多种拟合检验,发现标本量和离散性不是本文R2低值的主要原因。结论用同一方法对SARS-CoV和其他3组冠状病毒的中性突变速率进行比较研究,结果显示两者明显不同或具不同的模式;提示和其他3组冠状病毒相比较,SARS-CoV在分子进化或起源模式上似有特别之处。

引用

页码：1026 / 1030

页数：5

共 9 条

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