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肠道病毒71型中国分离株全基因组核苷酸序列分析
被引:34
作者
:
杨帆
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病毒基因工程国家重点实验室!北京,病毒基因工程国家重点实验室!北京,病毒基因工程国家重点实验室!北京,病毒基因工程国家重点实验室!北京,病毒基因工程国家重点实验室!北京
杨帆
金奇
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金奇
何雅青
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何雅青
李良成
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李良成
侯云德
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侯云德
机构
:
[1]
病毒基因工程国家重点实验室!北京,病毒基因工程国家重点实验室!北京,病毒基因工程国家重点实验室!北京,病毒基因工程国家重点实验室!北京,病毒基因工程国家重点实验室!北京
来源
:
中国科学(C辑:生命科学)
|
2001年
/ 02期
关键词
:
肠道病毒71型;
核苷酸序列分析;
同源性分析;
D O I
:
暂无
中图分类号
:
R373 [人体病毒学(致病病毒)];
学科分类号
:
100103 ;
100705 ;
摘要
:
全基因组的5个首尾重叠的克隆,并在此基础上进行了全基因组(未包括多聚腺苷酸尾)7408个碱基的核苷酸序列测定.数据分析表明,SHZH98株与其他EV71毒株相比,5’UTR和3’UTR的长度和序列有一定的差异.同源性分析发现,与免疫源性密切相关的P1结构蛋白基因与台湾流行株的同源性最高,与欧美流行株的同源性较低,P2,P3区非结构蛋白基因的同源性与Coxsakievirus A16及MS,BrCr株较高,而与台湾流行株相比则较低.遗传进化分析发现,SHZH98株结构蛋白基因与台湾流行株亲缘关系较近,而非结构蛋白基因与Coxsakievirus A16及MS,BrCr株的亲缘关系较近.上述结果在分子水平上对肠道病毒71型中国分离株进行分析,并探索了中国分离株的可能进化途径,有助于肠道病毒71型及整个肠道病毒的基础研究和我国对于EV71所致疾病的预防.
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相关论文
共 2 条
[1]
我国深圳地区手足口病患者肠道病毒71型的分离与鉴定
[J].
何雅青
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深圳市卫生防疫站,病毒基因工程国家重点实验室
何雅青
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杨帆
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金奇
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深圳市卫生防疫站,病毒基因工程国家重点实验室
金奇
.
中华实验和临床病毒学杂志,
1999,
(01)
:83
-84
[2]
医学分子病毒学.[M].金奇主编;.科学出版社.2001,
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共 2 条
[1]
我国深圳地区手足口病患者肠道病毒71型的分离与鉴定
[J].
何雅青
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何雅青
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杨帆
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杨帆
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李良成
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杨洪
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深圳市卫生防疫站,病毒基因工程国家重点实验室
杨洪
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陈淑霞
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金奇
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深圳市卫生防疫站,病毒基因工程国家重点实验室
金奇
.
中华实验和临床病毒学杂志,
1999,
(01)
:83
-84
[2]
医学分子病毒学.[M].金奇主编;.科学出版社.2001,
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