利用不同实时定量PCR方法分析相对基因表达差异

被引：46

作者：

余舜武

刘鸿艳

罗利军

机构：

[1] 上海市农业生物基因中心作物遗传改良国家重点实验室种质资源分室(上海)

来源：

作物学报 | 2007年 / 07期

关键词：

相对定量; 标准曲线; 实时荧光定量PCR; OsRDB1;

D O I：

暂无

中图分类号：

S188 [农业生物工程];

学科分类号：

071007 ; 0828 ; 0836 ; 090102 ;

摘要：

利用实时荧光定量PCR方法分析目标基因转录本之间的表达差异,目前常用的分析实验数据的有绝对定量和相对定量方法。为了克服绝对定量方法的繁琐和简化相对定量的分析方法,分别利用2-ΔΔCt、2-ΔCt和标准曲线法对水稻OsRDB1基因在不同化学试剂和激素处理下的表达差异进行了分析,发现2-ΔΔCt必须引入标准的看家基因作为参考,计算方法繁琐,计算结果受扩增效率影响;而利用2-ΔCt和标准曲线法计算方便,节省定量PCR试剂,但其结果易受到RNA浓度测量准确率的影响,其中标准曲线法引入斜率消除扩增效率的影响,最能测得实际的原始拷贝数差异。

引用

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