基于药物疗效日志的临床路径挖掘方法

被引:2
作者
李睿易 [1 ,2 ]
鲁法明 [1 ]
包云霞 [1 ]
曾庆田 [1 ]
朱冠烨 [1 ]
机构
[1] 山东科技大学计算机科学与工程学院
[2] 中国科学院计算技术研究所
关键词
过程挖掘; 词对隐狄利克雷分布模型; 概率后缀树; 临床路径;
D O I
10.13196/j.cims.2019.04.026
中图分类号
TP311.13 []; R197.3 [医院、综合医院];
学科分类号
1201 ; 1004 ; 120402 ;
摘要
标准临床路径对于规范治疗流程、提高治疗效果具有重要作用,但当前的临床路径是面向同一病种的所有患者制定的,无法体现患者或者医疗部门的个性化信息。为了实现符合患者和医疗部门特点的个性化临床路径,从医疗信息化系统中记录的患者处方数据出发,进行药物治疗临床路径的挖掘。首先由处方数据结合DrugBank数据库生成患者的每日用药疗效文档;然后使用词对隐狄利克雷分布模型对这些药物疗效文档进行主题聚类,得到患者每日所用药物对应的疗效主题;最后以各个患者的药物疗效主题序列为输入,训练概率后缀树模型作为药物治疗的临床路径模型,该模型既可以辅助专家进行个性化临床路径的制定,也可以用于患者后续服用药物的推荐。以MIMIC-Ⅲ数据库中肺炎患者的处方数据为实例,对所提方法的可行性和有效性进行了验证。
引用
收藏
页码:1017 / 1025
页数:9
相关论文
共 10 条
[1]   基于参考模型的临床路径挖掘 [J].
黄俊捷 ;
莫天宇 ;
金涛 ;
王建民 .
计算机集成制造系统, 2018, 24 (07) :1642-1652
[2]   基于优化主题模型的临床路径挖掘 [J].
徐啸 ;
金涛 ;
王建民 .
软件学报, 2018, 29 (11) :3295-3305
[3]   基于临床实践指南的诊疗过程建模方法 [J].
杨丽琴 ;
康国胜 ;
张亮 .
计算机集成制造系统, 2017, 23 (05) :1040-1049
[4]  
序列模式挖掘在临床路径发现问题中的研究与应用[D]. 韩旭.中国科学技术大学. 2017
[5]  
基于临床合理用药的数据挖掘技术和应用研究[D]. 庄军.重庆大学. 2006
[6]   Probabilistic topic models for sequence data [J].
Barbieri, Nicola ;
Manco, Giuseppe ;
Ritacco, Ettore ;
Carnuccio, Marco ;
Bevacqua, Antonio .
MACHINE LEARNING, 2013, 93 (01) :5-29
[7]   Sequential latent Dirichlet allocation [J].
Du, Lan ;
Buntine, Wray ;
Jin, Huidong ;
Chen, Changyou .
KNOWLEDGE AND INFORMATION SYSTEMS, 2012, 31 (03) :475-503
[8]  
Process Mining for Clinical Workflows: Challenges and Current Limitations[J] . Stig Kj&aelig,r Andersen,Gunnar O. Klein,Stefan Schulz,Jos Aarts,M. Cristina Mazzoleni,Martin Lang,Thomas B&uuml,rkle,Susanne Laumann,Hans-Ulrich Prokosch.Studies in Health Technology and Informatics . 2008
[9]  
Analyzing state sequences with probabilistic suffix trees:the PST R package .2 GABADINHO A,RITSCHARD G. Journal of Statistical Software . 2016
[10]  
OrderRex:clinical order decision support and outcome predictions by data-mining electronic medical records .2 CHEN J H,PODCHIYSKA T,ALTMAN R B. Journal of the American Medical Informatics Association . 2016