一种面向基因与疾病关系的文本挖掘方法

被引：2

作者：

龚乐君 ^{[1
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]}

韦有兵 ^{[1
]}

谢建明 ^{[1
]}

袁志栋 ^{[1
]}

孙啸 ^{[1
]}

机构：

[1] 东南大学生物电子学国家重点实验室

[2] 淮阴工学院计算机工程学院

来源：

东南大学学报(自然科学版) | 2010年 / 40卷 / 03期

关键词：

生物医学; 文本挖掘; 关系抽取; 实体识别;

D O I：

暂无

中图分类号：

TP391.1 [文字信息处理];

学科分类号：

081203 ; 0835 ;

摘要：

结合模式匹配、生物医学本体及共现技术,设计了一种自动抽取基因与疾病、基因与基因之间关系的文本挖掘方法,并开发了一个可以处理海量文本数据的系统.该系统可抽取与疾病相关的基因实体,挖掘基因与疾病、基因与基因之间的关系,衡量基因与疾病实体的相关性,并为分析基因与疾病、基因与基因之间的关系提供了网络可视化工具.实验结果表明,系统在测试数据集上抽取基因与疾病之间的关系可获得83.0%的综合测评率,抽取基因与基因之间的关系可获得78.5%的综合测评率.该系统已成功应用于乳腺癌及相关基因的研究.

引用

页码：486 / 490

页数：5

共 4 条

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