酶-配体复合物亲和性的计算

被引:2
作者
王任小
李维忠
来鲁华
唐有祺
机构
[1] 北京大学物理化学研究所!北京,,北京大学物理化学研究所!北京,,北京大学物理化学研究所!北京,,北京大学物理化学研究所!北京,
关键词
药物设计; 酶-配体复合物; 亲和性; 基于结构的定量构效关系;
D O I
暂无
中图分类号
O629 [天然化合物];
学科分类号
070303 ; 081704 ;
摘要
描述了一种新的计算酶-配体复合物亲和性的方法.它考虑了酶-配体结合过程中自由能变化的各主要因素,并利用经验公式加以计算、从蛋白质结构数据库中选取了66个酶-配体复合物作为训练集,利用回归分析得出最后的模型.此模型通用于各种类型的酶-配体复合物,计算结果比技准确,预测算合物解离常数的平均偏差小于一个数量级.此方法还可以定量评价配体分子中每个部分对结合过程的贡献大小,可以为先导他合物的优化提供非常直接的信息
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共 3 条
[1]  
Empirical scoring functions: I. The development of a fast empirical scoring function to estimate the binding affinity of ligands in receptor complexes[J] . Matthew D. Eldridge,Christopher W. Murray,Timothy R. Auton,Gaia V. Paolini,Roger P. Mee.Journal of Computer-Aided Molecular Design . 1997 (5)
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